Forskningen hans er bredt anerkjent og har mottatt en rekke priser. Ikke minst er Hessen kjent som en sterk formidler, og har høstet stor anerkjennelse for sin formidling av vitenskap. For eksempel gjennom bøker som befinner seg i skjæringspunktet mellom biologi og filosofi. I 2020 fikk han blant annet Brageprisens hederspris, for blant annet å i “flere tiår ha bidratt til å bygge bro mellom vitenskap og allmennhet”.
